核酸检测助力精准防控工作,加强核酸检测工作
邱毅代新
6月8日,国务院联防联控机制综合组公布《关于加快推进新冠病毒核酸检测的实施意见》,其中提到重点人群要“退房”,其他人群“愿意退房”。疾控中心定期对一般人群进行抽样监测和流行病学调查。
在常态化管控下,为什么要扩大核酸检测?居民做检测方便吗?实验室运行情况如何?检测试剂可靠吗?记者采访了相关部门。
方便居民检测吗?
所有来医院就医的发热病人和住院病人都要进行核酸检测,有条件的医疗机构也可以开展采样服务。
从5月中旬开始,北京大学人民医院门诊大楼旁搭起了一排遮阳棚,这是医院新成立的鼻拭子采集室。每天从早上7点半到下午5点,4名“全副武装”的护士在这里为患者做新冠肺炎核酸检测和采样。“扩大核酸检测范围后,我们的采样量从每天150人左右增加到450人左右。原来的取样室不够用,所以扩大了这个面积。”负责催收处的护士长说。
上午9点半,53岁的罗老师拿着门诊医生开具的化验单来到鼻拭子采集处。“您好,请出示行程单代码,让我查一下信息。”在采集室门口,护士先记录了罗老师的采样信息。随后,罗老师走到采样区坐下。护士拿出棉签,插入鼻腔。护士解释说,使用不开口的鼻拭子会降低暴露风险,采样时会深入咽部,保持15-30秒。
从登记信息到采样,罗先生用了5分钟,之后就可以通过手机上的医院官方APP查询检测结果。“10个小时就能出结果,很快。”罗老师说。
“不仅是这个采集室,我们还在急诊科和发热门诊安排采样人员。”北大医院医务部副主任张晓红表示,医院严格执行扩大核酸检测工作,所有发热患者、住院患者及陪护人员、发热或有呼吸道症状的急诊观察人员等,进行核酸检测。这些应该接受测试的人加上那些自愿接受测试的人每天要接受6次测试。
在北京大学人民医院住院楼16楼胸外科病房,马女士前几天刚做完肺部手术。“我们是从河北沧州来看病的。我和妈妈都做过核酸检测。”马的女儿肖琴说,他们一周前决定住院,医院安排他们做了新冠肺炎核酸检测、抗体检测和胸部CT。最后医生确认没有问题,他们就顺利入住了。“医院管得很严,我们也特别理解,积极配合。”小秦说。
“扩大核酸检测非常重要,这对医院控制感染非常有帮助。”张晓红说,医院应该主动加强核酸检测,以便尽早发现问题。
解放军总医院第五医学中心感染中心科副主任张欣分析,随着夏季的来临,医疗机构使用中央空调的频率越来越高,感染的风险也越来越大。扩大核酸检测范围,提高检测能力,可以筛查和发现无症状感染者,有利于降低感染风险,避免医院感染暴发。
4月24日,北京市卫健委发布《关于进一步做好新冠病毒核酸检测有关工作的通知》,支持体检机构在医院感防控、确保质量安全的基础上开展抽样服务。社会组织爱康集团反应迅速,取得了相关资质。4月30日,爱康日坛分公司体检中心正式启用“驱车通过”新冠肺炎核酸检测采样点,成为北京医疗机构首家“驱车通过”采样点。
何老师的儿子正赶上开学,学校通知他做核酸检测,何老师就在爱克上下单了
“在车上张嘴,一声‘啊’就完事了,这么快!”何老师认为,这种“免下车”核酸检测服务不用排队,大部分流程都在网上完成。取完样品,开车只要3分钟,一点都不浪费时间。
“‘免下车’测试是在室外通风的环境下进行的,同时可以减少人在车内的接触,更加安全高效。”爱康北京医疗管理集团副总经理李秀池说。目前,北京市核酸检测机构已增至70家。为了方便居民,还设立了多个采样点,日检测量为51000份。
实验室管理安全吗?
加强各地实验室检测质量控制,使核酸检测做到“量”和“质”并重,为常态化疫情防控提供有力的技术支撑。
6月2日,国务院联防联控机制医疗救治组发布《关于做好疫情常态化防控下新冠病毒核酸检测质量控制工作的通知》,要求各地加强实验室检测质量控制,使核酸检测保质保量,为常态化疫情防控提供有力技术支撑。
早上8点,解放军总医院第五医疗中心发热门诊护士尹青准时上班,开始逐一采集患者咽拭子样本。她将样本装入一次性病毒采样管,用双层密封袋包裹,小心翼翼地放入黄色样本转移桶。临近中午,工作人员将转运桶放入转运箱,送至检验科医学中心强化生物二级负压实验室。
临床医学中心的李波医生和他的同事正在实验室等候。他们穿着一体式防护服、手套、鞋套、防护面罩和N99口罩。疫情刚开始的时候,这个设备在负压下喘不过气来,但是坚持了五个多月,现在他们已经适应了。
李波将样本转移桶放入生物安全柜,打开后,进行核酸提取、离心、加压等操作,大约需要一个半小时。之后,他将灭活的病毒转移到荧光定量核酸扩增仪上,大约两个小时后才能得到检测结果。一批样本检验完后,他会打开紫外线灯,进行严格的消毒程序。“从拿到样本到给出报告,你要在里面待5个小时左右。有一次,我们为了一个急诊病人,从半夜12点一直工作到凌晨5点。”
“拓展新
冠病毒核酸检测,离不开专业实验室的支撑。”解放军总医院第五医学中心临床检验医学中心主任李伯安介绍,第五医学中心是新冠肺炎定点医院,在传染病防治和研究上有丰富的经验和强大的人才、技术储备。1月下旬,临床检验医学中心“P2 ”负压实验室正式启动运行,2月初,经过北京市相关部门评审、比对,该医院成为北京首家获批“新冠病毒核酸检测单位”的驻京军队医院,也是全市最早在负压实验室中开展核酸检测的机构之一。“别看实验室不大,但在疫情中发挥了巨大作用。就在这6平方米的负压区域,12名检测组员轮班,从早上8点工作至凌晨,最多每天检测约8份样本,常态化管理下日均检测约份样本,满足了医院患者以及复工复产体检等核酸检测需要。”李伯安说,3月底,医院最后一名确诊患者出院,此后检测样本量反而增加了,这是因为恢复常规诊疗服务后,住院患者和陪同人员,以及自愿到医院检测的团体人数都显著上升。
新冠病毒具有高致病性,为了保障实验室安全,临检中心对实验室人员、设备、材料、制度、环境等都有严格的规定,每个环节都不能出纰漏。比如检测人员都经过岗前技术培训,必须持有PCR(基因扩增技术)证;实验室还要进行生物安全风险评估,对病毒样本溢洒、操作失误等情况都制定了应对措施。
“扩大核酸检测在人力物力上投入较多,但可能是目前最有效的发现手段。”李伯安说,当前患者还没有清零,散发病例仍然存在,加上全球疫情蔓延,短期内又没有疫苗上市,在这种情况下,我国要推动复工复产和开放合作,扩大核酸检测是最可行的应对之策,可以尽早尽快找出传染源。
为进一步提升批量检测能力,第五医学中心临检中心改进了核酸样本提取方法,使得提取浓度提升了2.5倍,同时对样本使用双试剂检测,提升灵敏度、特异性。在北京市临检中心组织的实验室间质量评价和北京疾控中心组织的飞行检查中,均为1%合格。
“新冠病毒核酸检测中有个指标是CT值,一般来说,它大于38就是阴性,小于38就是阳性,而刚治愈的患者的CT值往往是变化的,不是按照38这个值‘一刀切’的。有的患者快要出院,检测CT值却在38附近波动,这时候我们就不能轻易让其出院,而是坚持双试剂检测,并适当放宽CT值诊断的范围,确保患者真正转为阴性再出院。这也是我们长期研究传染病形成的经验。”李伯安说。
检测结果准确吗?
核酸检测仍是临床诊断新冠肺炎的“金标准”。只有检测特定的病毒核酸,才可以排除其他病原体的感染
近日,国家卫健委副主任曾益新表示,在对疫情风险、检测能力进行全面科学评估的基础上,扩大核酸检测的范围,既有利于精准防控,保护群众健康,又有助于人员的合理流动、推动社会经济和生活秩序的全面恢复。
有人提出,核酸检测存在假阴性等问题,如今扩大核酸检测,其结果是否可靠?李伯安认为,目前核酸检测仍是临床诊断新冠肺炎的“金标准”。只有检测特定的病毒核酸,才可以排除其他病原体的感染。做CT无法确定是不是新冠肺炎,而抗体检测等检测手段,在灵敏度和特异性上也不够理想,所以只能作为核酸检测的补充、辅助。
“核酸检测理论上做不到1%的灵敏度和特异性,但我们可以尽量提高其准确性。假阴性问题大都是可以分析原因的,比如咽拭子取样有没有刮到上皮细胞、样本取自上呼吸道还是下呼吸道、样本运输存储时间是不是太长、样本提取溶液浓度的高低等,每一个步骤我们都要进行研究、改进,并严格执行,这样才能提高检测结果的准确性。”李伯安说。
对于我国核酸检测技术能力,科技部社会发展科技司司长吴远彬表示,总体来看,我国检测试剂的技术水平和产品性能与发达国家处于同一水平,检测产品的产能基本满足当前需要。“根据发布的病毒序列,有关检测企业和研究机构2周之内完成了核酸检测试剂的研发和产业化应用,快速实现检测试剂从无到有的突破。并不断根据需要,在检测的灵敏度、便捷性方面持续改进,产品性能也不断提升。”
中山大学达安基因公司董事长何蕴韶认为,我国核酸检测试剂的产能和质量均是世界领先。3月份,国家卫健委临床检验中心做了889家核酸检测实验室质评,阳性符合率达97%。
国家卫健委医政医管局监察专员郭燕红近日透露,我国每天的检测能力能够达到150万份。为进一步提高检测能力,下一步将加强二级以上医疗机构的实验室建设,同时将加强生物安全管理、实验室管理,以及医务人员培训等,以适应复工复产之后医疗服务和全社会对核酸检测的需求。
什么是乙肝?
很多人患有乙肝之后并不知情,只是在偶尔体检的时候,才会被告知乙肝。
那么很多人就会迷茫了,乙肝到底是什么?
今天,我来为大家讲一讲;
什么是乙肝呢?
乙肝就是“乙型肝炎”的简称。
乙肝在我国似乎是一个尽人皆知的疾病,但要详细说清楚什么是乙肝,不要说普通老百姓,很多不是搞肝病专业的医生恐怕也说不太明白。
肝炎,顾名思义,就是肝脏的炎症反应,炎症反应从病理学上解释起来非常复杂。
简单地说,主要是肝细胞及其周围组织的变性、坏死、再生及伴随的纤维化等,一系列非常复杂的病理反应。
肝脏炎症反应必然导致肝脏功能和结构的破坏和变化。
如果是急性肝炎,通过治疗后可能基本上恢复如初,甚至整个过程患者可以不表现任何症状。
但不幸的是,对于乙型肝炎来讲,危害较大的类型,也是最常见的类型是慢性肝炎,病程从半年到数十年不等。
目前已知的肝炎病毒有五种,根据发现的先后,我国命名为甲型、乙型、丙型、丁型、戊型。
其他国家则多命名为A型、B型、C型、D型、E型。
所以境外华人也常说“B型肝炎”或简称“B肝”,和乙肝是一个意思。
对于乙肝,非专业人士往往有很多误解,或者说是概念上的混淆,主要有以下两种情况:
1.得了乙肝就是终身不愈,非常恐怖?如上所述,乙型肝炎分为急性和慢性,病程在6个月以内者为急性肝炎,超过6个月者为慢性肝炎。
5岁以下婴幼儿感染乙肝病毒绝大多数发展为慢性感染。
5岁以上儿童或成人,其感染多为急性过程,可以痊愈。
另外,慢性乙型肝炎通过正确治疗绝大多数可以控制,小部分也可以治愈。
2.所有慢性乙肝病毒感染者都是乙肝吗?人体可以终身携带乙肝病毒,但是,只有肝脏出现明显的炎症反应时,才称为“乙型肝炎”。
慢性乙肝病毒感染者可以长期甚至终身无明显的肝脏炎性反应。
然而,乙肝病毒对人体造成的危害,主要是由反复发生的肝脏炎性反应造成的。
注意:医学科普不能代替诊疗,请遵医嘱。
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什么是PCR?
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究 的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研 究和检测鉴定。过去几天几星期才能做到的事情,用PCR几小时便可完成。PCR技术是生物医学领域中的一项革命性创举和里程碑。PCR技术简史
PCR的最早设想 核酸研究已有100多年的历史,本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术,Korana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:“经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因”。
PCR的实现 1985年美国PE-Cetus公司人类遗传研究室的Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应。其原理类似于DNA的体内复制,只是在试管中给 DNA的体外合成提供以致一种合适的条件---摸板DNA,寡核苷酸引物,DNA聚合酶,合适的缓冲体系,DNA变性、复性及延伸的温度与时间。
PCR的改进与完善 Mullis最初使用的DNA聚合酶是大肠杆菌DNA聚合酶I的 Klenow片段,其缺点是:①Klenow酶不耐高温,90℃会变性失活,每次循环都要重新加。②引物链延伸反应在37℃下进行,容易发生模板和引物之 间的碱基错配,其PCR产物特异性较差,合成的DNA片段不均一。此种以Klenow酶催化的PCR技术虽较传统的基因扩增具备许多突出的优点,但由于 Klenow酶不耐热,在DNA模板进行热变性时,会导致此酶钝化,每加入一次酶只能完成一个扩增反应周期,给PCR技术操作程序添了不少困难。这使得 PCR技术在一段时间内没能引起生物医学界的足够重视。1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合酶进行PCR,其扩增的DNA片段很均一,真实性也较高,只有所期望的一种DNA片段。但每循环一次,仍需加入新酶。1988年Saiki 等从温泉中分离的一株水生嗜热杆菌(thermus aquaticus) 中提取到一种耐热DNA聚合酶。此酶具有以下特点:①耐高温,在70℃下反应2h后其残留活性大于原来的90%,在93℃下反应2h后其残留活性是原来的 60%,在95℃下反应2h后其残留活性是原来的40%。②在热变性时不会被钝化,不必在每次扩增反应后再加新酶。③大大提高了扩增片段特异性和扩增效 率,增加了扩增长度(2.0Kb)。由于提高了扩增的特异性和效率,因而其灵敏性也大大提高。为与大肠杆菌多聚酶I Klenow片段区别,将此酶命名为Taq DNA多聚酶(Taq DNA Polymerase)。此酶的发现使PCR广泛的被应用。
PCR技术基本原理
PCR技术的基本原理 类似于DNA的 天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加 热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引 物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合 物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需 2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。到达平台期(Plateau)所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。
PCR的反应动力学 PCR的三个反应步骤反复进行,使DNA扩增量呈指数上升。反应最终的DNA 扩增量可用Y=(1+X)n计算。Y代表DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次的扩增效率,n代表循环次数。平均扩增效率的理论值为100%, 但在实际反应中平均效率达不到理论值。反应初期,靶序列DNA片段的增加呈指数形式,随着PCR产物的逐渐积累,被扩增的DNA片段不再呈指数增加,而进 入线性增长期或静止期,即出现“停滞效应”,这种效应称平台期数、PCR扩增效率及DNA聚合酶PCR的种类和活性及非特异性产物的竟争等因素。大多数情 况下,平台期的到来是不可避免的。
PCR扩增产物 可分为长产物片段和短产物片段两部分。短产物片段的长度严格地限定在两个引物链5’端之间,是需要扩增的特定片段。短产物片段和长产物片段是由于引物所 结合的模板不一样而形成的,以一个原始模板为例,在第一个反应周期中,以两条互补的DNA为模板,引物是从3’端开始延伸,其5’端是固定的,3’端则没 有固定的止点,长短不一,这就是“长产物片段”。进入第二周期后,引物除与原始模板结合外,还要同新合成的链(即“长产物片段”)结合。引物在与新链结合 时,由于新链模板的5’端序列是固定的,这就等于这次延伸的片段3’端被固定了止点,保证了新片段的起点和止点都限定于引物扩增序列以内、形成长短一致的 “短产物片段”。不难看出“短产物片段”是按指数倍数增加,而“长产物片段”则以算术倍数增加,几乎可以忽略不计, 这使得PCR的反应产物不需要再纯化,就能保证足够纯DNA片段供分析与检测用。
PCR反应体系与反应条件
标准的PCR反应体系:
10×扩增缓冲液 10ul
4种dNTP混合物 各200umol/L
引物 各10~100pmol
模板DNA 0.1~2ug
Taq DNA聚合酶 2.5u
Mg2+ 1.5mmol/L
加双或三蒸水至 100ul
PCR反应五要素: 参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物: 引物是PCR特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。
设计引物应遵循以下原则:
①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。
②引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。
③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3’端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。
⑤引物3’端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。
⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。
⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。
引物量: 每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。
酶及其浓度 目前有两种Taq DNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反应约需酶量2.5U(指总反应体积为100ul时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。
dNTP的质量与浓度 dNTP的质量与浓度和PCR扩增效率有密切关系,dNTP粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。dNTP溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以1M NaOH或1M Tris。HCL的缓冲液将其PH调节到7.0~7.5,小量分装, -20℃冰冻保存。多次冻融会使dNTP降解。在PCR反应中,dNTP应为50~200umol/L,尤其是注意4种dNTP的浓度要相等( 等摩尔配制),如其中任何一种浓度不同于其它几种时(偏高或偏低),就会引起错配。浓度过低又会降低PCR产物的产量。dNTP能与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度降低。
模板(靶基因)核酸 模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。 SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀;蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀 核酸。提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接 用于PCR扩增。RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。
Mg2+浓度 Mg2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR反应中,各种dNTP浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为1.5~2.0mmol/L为宜。Mg2+浓度过高,反应特异性降低,出现非特异扩增,浓度过低会降低Taq DNA聚合酶的活性,使反应产物减少。
PCR反应条件的选择
PCR反应条件为温度、时间和循环次数。
温度与时间的设置: 基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法, 除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性)。
①变性温度与时间:变性温度低,解链不完全是导致PCR失败的最主要原因。一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于93℃则 需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物完全变性,就会导致PCR失败。
②退火(复性)温度与时间:退火温度是影响PCR特异性的较重要因素。变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长 度。对于20个核苷酸,G+C含量约50%的引物,55℃为选择最适退火温度的起点较为理想。引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:
Tm值(解链温度)=4(G+C)+2(A+T)
复性温度=Tm值-(5~10℃)
在Tm值允许范围内, 选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合,提高PCR反应的特异性。复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模板之间完全结合。
③延伸温度与时间:Taq DNA聚合酶的生物学活性:
70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子
70℃ 60核苷酸/S/酶分子
55℃ 24核苷酸/S/酶分子
高于90℃时, DNA合成几乎不能进行。
PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。PCR延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min是足够 的。3~4kb的靶序列需3~4min;扩增10Kb需延伸至15min。延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出现。对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些。
循环次数 循环次数决定PCR扩增程度。PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度。一般的循环次数选在30~40次之间,循环次数越多,非特异性产物的量亦随之增多。
PCR反应特点
特异性强 PCR反应的特异性决定因素为:
①引物与模板DNA特异正确的结合;
②碱基配对原则;
③Taq DNA聚合酶合成反应的忠实性;
④靶基因的特异性与保守性。
其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及Taq DNA聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行,结合的特异性大大增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高。
灵敏度高 PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10-12g)量级的起始待测模板扩增到微克(ug=10-6g)水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中最小检出率为3个细菌。
简便、快速 PCR反应用耐高温的Taq DNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4 小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。
对标本的纯度要求低 不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA 粗制品及总RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等粗制的DNA扩增检测。 PCR扩增产物分析
PCR产物是否为特异性扩增 ,其结果是否准确可靠,必须对其进行严格的分析与鉴定,才能得出正确的结论。PCR产物的分析,可依据研究对象和目的不同而采用不同的分析方法。
凝胶电泳分析:PCR产物电泳,EB溴乙锭染色紫外仪下观察,初步判断产物的特异性。PCR产物片段的大小应与预计的一致,特别是多重PCR,应用多对引物,其产物片断都应符合预讦的大小,这是起码条件。
琼脂糖凝胶电泳: 通常应用1~2%的琼脂糖凝胶,供检测用。
聚丙烯酰胺凝胶电泳:6~10%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离效果比琼脂糖好,条带比较集中,可用于科研及检测分析。
酶切分析:根据PCR产物中限制性内切酶的位点,用相应的酶切、电泳分离后,获得符合理论的片段,此法既能进行产物的鉴定,又能对靶基因分型,还能进行变异性研究。
分子杂交:分子杂交是检测PCR产物特异性的有力证据,也是检测PCR 产物碱基突变的有效方法。
Southern印迹杂交: 在两引物之间另合成一条寡核苷酸链(内部寡核苷酸)标记后做探针,与PCR产物杂交。此法既可作特异性鉴定,又可以提高检测PCR产物的灵敏度,还可知其分子量及条带形状,主要用于科研。
斑点杂交: 将PCR产物点在硝酸纤维素膜或尼膜薄膜上,再用内部寡核苷酸探针杂交,观察有无着色斑点,主要用于PCR产物特异性鉴定及变异分析。
核酸序列分析:是检测PCR产物特异性的最可
PCR是什么意思?
“PCR"的意思是:abbr. 光电导继电器(Photo-conductive Relay);程序控制暂存器(program control register)
1、相关短语:
数字PCR digital PCR ; ddPCR
rt pcr 逆转录聚合酶链反应 ; SARS病毒 ; 逆转录 ; 聚合酶链反应
PCR技术 polymerase chain reaction ; PCR technique ; PCR technology ; PCR
2、例句:
Deletion mutation state of the two groups of mitochondria DNA were detected by PCRtechnology and photodensity scan.
采用聚合酶链反应(PCR)技术和光密度扫描检测两组线粒体DNA的缺失突变情况。
扩展资料:
光电继电器的特点:
1、控制功率小:输入很小的控制电流便能正常工作,输出采用大功率管可控硅器件,具有功率放大作用。
2、可靠性:绝缘防水材料浇铸,没有可动部件。
3、抗干扰能力强:无触点动作,无火花等电磁干扰,输入/输出之间隔离。
3、动作快:直流SSR——响应时间<几十μS过零交流SSR——转换时间≤10Ms(1/2f s f = 50Hz)。
4、寿命长:1012~1013次 (普通电磁式继电器105~106次)。
5、承受的浪涌电流大:6~10倍额定值。
6、对电源电压适应范围广:交流SSR——30~220VAC 任意选择。
7、耐压水平高:输入/输出介质耐压2.5kV以上。
参考资料来源:百度百科-光电继电器
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