1、两者隶属类别不同

机电工程资质隶属于建筑施工总承包资质，而建筑机电安装资质隶属于建筑专业承包资质。

2、办理条件不同

机电工程资质办理条件高于建筑机电安装资质，以同等级三级资质为例，机电工程资质要求企业净资产800万以上，建筑机电安装资质净资产只需达到400万。办理机电工程施工总包资质所需的各类注册人员和技术人员几乎是机电安装工程专包资质的两倍。

3、业务范围不同

机电工程资质业务范围大于建筑机电安装资质，以同等级三级资质为例，机电工程总包三级可承担单项合同额1500万元以下的各类机电工程的施工，而建筑机电安装专包三级只能承担单项合同额1000万元以下的各类建筑工程项目的设备、线路、管道的安装，非标准钢结构件的制作、安装。

搜狗百科-机电工程施工总承包资质标准

搜狗百科-建筑机电安装工程专业承包资质标准